Em fevereiro de 2004, Emilinha foi hospitalizada após cair da cama e fraturar o braço direito.
Em junho de 2005, ela esteve internada após cair de uma escada e sofrer traumatismo craniano e hemorragia intracerebral.
Morreu na tarde do dia 3 de outubro de 2005 (há exatos 17 anos) de infarto fulminante, enquanto almoçava em seu apartamento no bairro de Copacabana, no Rio de Janeiro, aos 82 anos.
Seu corpo foi velado durante toda a noite e pela manhã, por amigos, familiares e fãs, na Câmara dos Vereadores no Rio de Janeiro e sepultado no Cemitério do Caju.
